한국신약개발연구조합(이사장 조의환, 이하 연구조합)은  '조세특례제한법 시행령 일부 개정령 안”에 포함 되지 않은 '제약분야 신약R&D 세액공제 대상 원천기술'을 발굴, 세액공제 대상기술로 지정 받을 수 있도록 기획재정부에 적극 건의키로 했다. 

조합은 이를 위해 신약(합성/바이오, 혁신/개량, 천연물) 연구개발을 하고 있는 모든 혁신형 제약기업을 대상으로 제약분야 신약R&D 세액공제 대상 원천기술 선정을 위한 수요조사”를 실시할 방침이다.

현재 기획재정부 조세특례제도과에서는 2010년 1월 13일자로 '조세특례제한법 시행령 일부 개정령 안(제출자 : 국무위원 윤증현 기획재정부장관)'을 관계 부처별로 의견 조회 중으로, 조합은 금주까지 수요조사를 완료해 결과를 보건복지가족부에 제출, 협의하게 된다.

조합 이강추 회장은 "우리 혁신형 제약기업의 신약 연구개발 관련 조세지원의 첫 발걸음을 내딛는 매우 급박하고 중대한 사안으로, 이번 일부 개정령 안을 살펴보면 신약개발 중심 혁신형 제약기업의 기대와는 달리 10년 이내의 단·중·장기 R&D 재투자 캐쉬카우로서 매우 중요한 ‘저분자신약개발’이나 ‘개량신약개발’이 R&D투자에 대한 세제지원 대상에서 모두 제외돼  있다"며 "수요조사를 바탕으로 한 근거 있는 자료 제출을 통해 혁신형 제약기업들이 한 목소리로 강력하게 대 정부 건의를 전개 할 필요성이 있다"고 밝혔다.

한편 정부는 신성장동력산업과 원천기술을 중심으로 R&D투자에 대한 세제지원을 OECD 최고 수준으로 강화하기로 결정함에 따라 세부 방안을 수립해 17개 신성장동력산업별로 세액 감면대상을 발굴, 당기 R&D의 3 - 6%(중소기업 25%)에서 20%(중소기업 30%)로 인상했다.

또 산업경쟁력을 결정짓는 핵심 원천기술 분야는 당기 R&D의 25%(중소기업 35%) 수준으로 인상했다.

세제지원계획은 2012년까지 일몰제로 운영하고 제도의 적정성을 평가하여 연장여부를 결정한다는 방침이다.